感染性心内膜炎可能会引起心衰、心肌脓肿、急性心肌梗死等严重并发症，临床数据表明没有经过治疗的急性感染性心内膜炎患者，部分患者会在30天内因各种并发症而死亡，亚急性的患者可存活6个月以上。确诊为感染性心内膜炎的患者经过给予药物或手术等积极治疗后能明显降低死亡率，但该疾病的患者死亡率还是比较高，治疗痊愈以后生存期能达到5年的患者大约在60%-70%之间，也就是有大约30%的患者会因各种并发症在5年内死亡。以上数据只是相对的，具体到每位患者能够活多久、生存多长时间和患者的疾病严重程度、年龄等因素有关。
